本組原為建築歷史與理論組，其成立乃基於建築歷史與理論之相關研究與建築設計在學科本質上的差異，而於1994 年自設計組分離出來。基本教學目標為培養建築歷史與理論之專業研究人員，提升建築專業者在文化資產保存理論與實務之專業知識，及強化建築歷史、文化資產保存理論與建築設計專業之連結。
之後，鑑於文化資產保存已形成一門專業，於民國2001 年將建築歷史與理論組的名額撥出一半，成立「文化資產保存」組。然於施行一年之後，經由檢討，自2002 年年起將此兩組結合為「建築歷史與保存組」，並延續「建築歷史與理論組」原有的目標。2008 年「建築歷史與保存組」於碩士班與「設計理論與運算組」及「建築與環境規劃組」為「泛設計組」，博士班仍為獨立之「建築歷史與保存組」。2014 年「建築歷史與保存領域」於碩士班與及「設計理論與運算領域」為「設計組」，而在博士班仍為獨立之「建築歷史與保存組」。考量當前建築史論與文化資產保存未來的發展趨勢，2017 年起將「建築歷史與保存領域」獨立設組，成立「建築歷史與文化資產保存組」碩士班與博士班。
本組現階段由孫全文名譽教授、徐明福名譽教授、傅朝卿名譽教授、吳秉聲教授、黃恩宇助理教授及宋立文助理教授負責。相關課程除由專兼任教師開設建築歷史與保存之相關課程外，亦結合他組（如建築結構、都市設計、建築構造等教師）共同開設相關課程，以提供碩、博士班學生在建築歷史與保存專業上全盤且具深度的課程。
本組歷年來的研究成果，不論是獨自進行或共同參與的，主要包括有：古蹟及歷史建築之調査研究與修護計畫之研擬、古蹟及歷史建築普査、古蹟修護工程施工記錄、古蹟與歷史建築修復倫理及技術之研究、台灣聚落歷史之研究、歷史街區保存與社區總體營造個案之研究與規劃、台灣日治時期建築歷史之研究、台灣傳統建築歷史之研究等。近年來，研究領域也聚焦在文化資產數位典藏及世界文化遺產維護的議題上。